علیرضا زاکانی، نماینده مجلس هم دوشنبه شب با حضور در یک برنامه تلویزیونی با تایید خسارات سنگین به این مجموعه در نطنز کفت: نمایندگان بعد از بازدید از میزان خسارات وارد شده خون گریه می‌کردند. بخشی از تأسیسات کاملاً تعطیل شده و از بین رفته است.
البته این در حالی است که مقامات اعلام کردند که روند غنی سازی در نطنز متوقف نشده است و کار همچنان ادامه دارد و عراقچی از آغاز دوباره غنی سازی ۶۰ درصدی خبر داده است.
اما اتفاقات نطنز، سرآغاز تحلیل‌هایی درباره تاثیر این حادثه بر قدرت چانه‌زنی ایران در مذاکرات وین شد. بسیاری از رسانه‌های غربی اعلام کردند که در شرایط جدید ایران اهرم فشار خود را در مذاکرات از دست داده و قدرت مواضع تهران کاهش پیدا کرده است.مقامات دولت روحانی که مسئولیت مذاکرات وین را برعهده دارد نیز یکی پس دیگری بر ارتباط میان حادثه نطنز و مذاکرات وین صحه گذاشتند. علی اکبر صالحی رییس سازمان انرژی اتمی اعلام کرد اقدام علیه مرکز غنی‌سازی نطنز نشان دهنده ناکامی مخالفان مذاکرات ایران برای رفع تحریم‌های ظالمانه است.محمد جواد ظریف وزیر خارجه ایران به طور رسمی اسرائیل را عامل خرابکاری در نطنز معرفی کرد و گفت اگر فکر می‌کنند دست ما در مذاکره ضعیف شده اتفاقا این عمل زبونه موضع ما را در مذاکرات قوی‌تر خواهد کرد.تحلیل جریان نزدیک به دولت و بسیاری از کارشناسان این است که اسرائیل قصد داشته با این خرابکاری ایران را وادار به اقدامات واکنشی کند. اقداماتی که در نهایت می‌تواند مسیر مذاکرات را تغییر دهد. با وجود تلاش‌های جریان اصولگرای مخالف دولت برای کوبیدن بر طبل جنگ تمام عیار با اسرائیل، یک نکته نباید از تحلیل‌ها دور بماند و آن اینکه تمامی خسارات وارده بر برنامه هسته‌ای ایران با هر هدفی که بوده (چه به قول تیم مذاکره کننده، آسیب زدن به مذاکرات هسته‌ای باشد چه به قول مخالفان مذاکرات تسریع روند گفتگوها)، نتیجه باگ امنیتی است.ذاکانی اذعان کرد که ایران به بهشت جواسیس تبدیل شده است. او با اشاره به مساله نفوذ به تاسیسات هسته‌ای ایران گفت: یک مجموعه پر ظرفیت هسته‌ای که در پی خرابی برای تعمیر به خارج از کشور منتقل شده بود با ۳۰۰ پوند مواد منفجره به کشور بازگردانده شد، اما سیستم امنیتی متوجه آن نشد. فارغ از ارتباط این حوادث به مذاکرات ایران و غرب باید به دنبال ریشه این گونه اتفاقات تلخ درون کشور بود. زنجیره‌ای از حوادث ناشی از نفوذ دشمن نشان می‌دهد سیستم اطلاعاتی کشور بر خلاف ادعا‌های مطرح شده در سریال‌هایی نظیر گاندو، باگ امنیتی دارد.